我校生物工程专业于2013年开始招生。学校早在1985年就开办了生物教育专科专业，以适应景德镇及周边地区对生物学科人才的需求。2004年以后，生物技术及应用专科专业又先后开办，2003年开始与江西师范大学联合开办生物科学本科专业，积累有一定的办学经验，奠定了良好的办学基础。
本专业培养目标为培养德、智、体、美、劳全面发展，具有较系统的生物工程的工艺技术过程和工程设计等基本理论、基本知识和基本技能，适应市场经济建设和社会发展需要的，能在工业、医药、食品、农、林、牧、渔、环保、园林等行业的企业、事业和行政管理部门从事生物工程产品生产、工艺设计、生产管理、新技术和新产品开发等高素质应用型人才。
本专业人才要求培养的人才要掌握生物工程的基础知识和基本理论，初步掌握生物工程研究的方法和手段，初步具备发现、提出、分析和解决生物工程相关问题的能力，熟悉生物工程及其产业的相关方针、政策和法规，具有一定的国际视野、一定的外语应用能力和跨文化交流合作能力，具有一定的创新意识、批判性思维和可持续发展理念，具有生物工程实践和技术革新的能力。基本学制4年，弹性学制4-6年。在规定的年限内修完本专业人才培养方案规定的学时和学分，方能毕业。取得毕业资格，并符合学校规定的授予学士学位的条件，授予工学士学位。
生物工程专业师资队伍方面，相关教职工合计11人，其中专任教师9人。有省级骨干教师1人次，新世纪百千万人才工程市级人选1人次，市级专业技术拔尖人才1人次。教研室有教授2人，副教授1人；有博士3人，硕士8人，硕士研究生以上教师达100%。
专业核心课程包括：细胞生物学、微生物学、分子生物学、基因工程、发酵工程、生物反应工程、生物分离工程、生物工程设备等。本专业建设有生物工程实验实训教学中心。内含实验室主要有：普通生物学实验室、植物组织培养实验室、标本室、分子生物学实验室、微生物实验室、生物化学实验室、发酵工程实验室、生物分离工程实验室、基因工程实验室、生物反应工程实验室等，教学仪器设备总值达逾700万元。配备有啤酒发酵大型设备、发酵罐、高效液相色谱层析仪、PCR仪等重要教学科研设备。另有校内外实践实训基地3个。近年来专任教师立项省、市级科技项目18项，发表SCI一篇，核心论文9篇，专利4项，本院教师的“液态食用菌培育技术”属国内首创。实验中心目前开展的铁皮石斛、金线莲、蓝莓等资源植物的组培快繁和林下扩大栽培项目独具特色。
2013年创办生物工程本科专业，2014年申报立项“江西省高校本科专业综合改革试点项目——生物工程专业”。该专业根据地方性、应用型的办学方向，进行了以“产教融合”为核心理念的专业综合改革试点，取得了一定的成果。专业改革充分突出了“产教融合”特点，建设过程中广泛开展校企合作，建立产、学、研、用一体化的人才培养模式，推动广大师生下到基层，进入企业，开展科研合作、人才培养合作和科技扶贫。积极推进实验、实训、实习和创新创业教育，突出体现人才培养中的应用型专业知识技能的培养和训练。通过5年多的耕耘和努力，目前生物工程专业已形成较为完备的教学体系，能够保障专业教学，并凸显了产教融合特点。具体建设成果包括：制定了具有地方性、应用型特点的人才培养方案；探索了产教融合的各种模式，组建了一支符合专业改革需求的师资队伍；构建了较为完备的实验教学体系；同企业合作取得了一定的科研成果；建设良好学风、人才培养效果突出。
自本科办学以来，生物工程专业已经有三届毕业生，毕业生考取硕士研究生40余人。其他学生根据自身情况，选择就业，就业率高达95%以上。
